Die Bände 9 und 10 stellten eine besondere Herausforderung dar, ist die Überlieferung im Bereich der einzelnen Choralbearbeitungen doch so komplex wie bei keiner anderen Werkgruppe. Daran knüpft sich die entscheidende Frage nach Bachs Autorschaft, die ja schon in der Vergangenheit äußerst kontrovers diskutiert wurde. Auch im Vorfeld unserer Ausgabe gab es hitzige Diskussionen darüber und Herausgeber und Verlag sind sich dessen bewusst, dass es sich bei der nun vorliegenden Auswahl um eine durchaus anfechtbare Momentaufnahme handelt. Mehr dazu in den Textteilen dieser beiden Bände.

Nicht ganz so dramatisch stellt sich die Lage für die Choralpartiten dar, wobei auch dieser Bestand aus Überlieferungsgründen auf Hauptteil, Anhang und Online-Präsentation aufgeteilt werden musste.

Die sogenannten „Neumeister-Choräle“ wurden in den Werkbestand der Choralbearbeitungen in alphabetischer Reihenfolge integriert, da sie keiner Sammlungsidee – wie etwa Bachs größere spätere Sammlungen – folgen. Der Hinweis „Neumeister-Sammlung“ erleichtert die Zuordnung.

Online dargestellt werden neben einigen Fassungen diejenigen Werke, die weiterer Forschung bedürfen, da ihr Profil weniger Hinweise auf den wahren Autor freilegt.